<h3>臨近2020年的春節(jié)，一場突如其來的病毒席卷全球，僅二十天天的時間就有成千上萬人被感染。</h3> <h5><font color="#ff8a00"><b>圖1.新冠分布圖</b><br></font></h5><div><font color="#ff8a00"><b><br></b></font></div><div>那么它究竟是什么東東呢？今天我們來科普一下吧。</div> <h1 style="text-align: center"><b><u><font color="#b06fbb">新型冠狀病毒的命名</font></u></b></h1> 2020年3 月 2 日，國際病毒分類委員會冠狀病毒研究小組（CSG）在《自然 - 微生物學(xué)》發(fā)表新型冠狀病毒的命名聲明，描述了新型冠狀病毒的命名方法和過程，并介紹病毒分類中的常見問題。<div><br><div>作者強調(diào)，新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）名稱中的 SARS 是為了突出它們與原始病毒在演化上的關(guān)系，而不是臨床疾病層面的關(guān)系。<br></div></div><div><br></div><div>歷史上，與特定病毒相關(guān)的疾病和宿主范圍是定義病毒的兩個關(guān)鍵特征。<br><br>然而，病毒的宿主可能是不確定的，病毒的致病性對于大多數(shù)病毒來說也仍然未知。作者認(rèn)為，基因組序列是絕大多數(shù)病毒已知的唯一特征，應(yīng)該用它來定義特定的病毒（如下圖2所示）。</div> <h5 style="text-align: left;"><b><font color="#ff8a00">圖2.基于系統(tǒng)發(fā)育的推理方法命名新型冠狀病毒</font></b></h5> 科的分類和具體方法由 CSG 負(fù)責(zé)，他們通過比較新病毒與已知病毒在分類中的關(guān)系來評估新病毒的位置，包括確認(rèn) SARS-CoV 的位置。<br><br>為命名新型冠狀病毒，作者評估了該病毒與已知冠狀病毒的遺傳相似性。通過對比基因組數(shù)據(jù)，特別是分析參與病毒復(fù)制的保守蛋白的變異，他們發(fā)現(xiàn)，新型冠狀病毒與嚴(yán)重急性呼吸綜合征相關(guān)冠狀病毒種（Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus）的病毒屬于同一簇（如下圖3所示）。<br> <h5><b><font color="#ff8a00"> 圖3.冠狀病毒的系統(tǒng)發(fā)育樹</font></b></h5> <h1 style="text-align: center;"><b><u><font color="#b06fbb">新冠病毒的治療</font></u></b></h1> 2020年3月2日，美國芝加哥大學(xué)、阿貢國家實驗室、西北大學(xué)Feinberg醫(yī)學(xué)院和加州大學(xué)河濱分校醫(yī)學(xué)院的團隊合作，在預(yù)印本網(wǎng)站 BioRxiv 發(fā)表論文：Crystal structure of Nsp15 endoribonuclease NendoU from SARS-CoV-2。<br>該研究解析了新冠病毒中一個可作為藥物研究靶向蛋白質(zhì)Nsp15的晶體結(jié)構(gòu)（如下圖4所示）。研究結(jié)果顯示，之前用于治療SARS的藥物能夠被研發(fā)用于治療新冠肺炎。<br><br>新冠病毒中Nsp15的結(jié)構(gòu)與SARS病毒中蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)相似程度高達(dá)89%。2010年有關(guān)SARS病毒的研究表明，抑制Nsp15的表達(dá)可以減慢病毒復(fù)制。因此研究團隊指出，之前任何靶向Nsp15的藥物都有可能成為治療新冠肺炎的特效藥。<br> <h5 style="text-align: left;"><b><font color="#ff8a00">圖4. 新冠病毒藥物靶向蛋白Nsp15的晶體結(jié)構(gòu)</font></b></h5> <h1 style="text-align: center;"><b><u><font color="#b06fbb">新冠病毒的起源和進(jìn)化</font></u></b></h1> 2020年3月3日，中國科學(xué)院主辦的《國家科學(xué)評論》（National Science Review）發(fā)表題為《關(guān)于SARS-CoV-2的起源和持續(xù)進(jìn)化》（On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2）的論文。北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物信息中心陸劍研究員與中國科學(xué)院上海巴斯德研究所崔杰研究員是這篇論文的共同通訊作者。<br><br>研究人員分析的103個新冠病毒基因組數(shù)據(jù)全部來源于公共數(shù)據(jù)庫。分析表明，這些病毒株一共存在149個突變位點，且多數(shù)突變在近期發(fā)生。<div><br>進(jìn)一步的數(shù)據(jù)分析表明，103個病毒株中的101個屬于兩個亞型之一。具體而言，兩個亞型的區(qū)別在于病毒RNA基因組的第28144位點，L型是T堿基（對應(yīng)亮氨酸，Leu），S型是C堿基（對應(yīng)絲氨酸，Ser）。通過與其他冠狀病毒比較，作者發(fā)現(xiàn)S型新冠病毒與蝙蝠來源的冠狀病毒在進(jìn)化樹上更接近，從而得出S型相對更古老的結(jié)論（如下圖5所示）。</div><div><br></div><div>那么，一個很自然的推論是：相對古老的S型新冠病毒應(yīng)該產(chǎn)生更多的病毒株，因其有更多的時間在人群中傳播。然而，基因組數(shù)據(jù)表明L型占70%，S型占30%，且每個L型病毒株比S型攜帶了相對較多的新生突變。為什么相對年輕的L型新冠病毒卻產(chǎn)生了更多的病毒株？作者推測，L型病毒傳播能力更強，或者在人體內(nèi)復(fù)制更快，因此可能意味著其毒力也更大。<br><br></div> <h5><b> <font color="#ff8a00">圖5.SARS-CoV-2的起源和持續(xù)進(jìn)化</font></b></h5> 2020年的驚蟄到了，萬物復(fù)蘇，愿我們能早點走出家門，擁抱自然！<h5><b><font color="#ed2308">說明：以上所有科學(xué)文獻(xiàn)均來自于澎湃新聞 Bioworld</font></b></h5>